Info Office umožňuje ukládat data do databáze MS Access nebo využít SQL serveru. Jedná se pouze o jinou technologii použitou pro ukládání dat. Uživatelské rozhraní je stejné a je tedy možné přejít z jedné databáze do druhé aniž by bylo nutné uživatele přeškolovat.

Databáze MS Access
Její výhodou je téměř nulová administrace. Veškerá správa je prováděna z Info Office. Je vhodná pro uživatele s řádově desítkami až několika stovkami tisíc dokladů ročně. Je součástí dodávky Info Office a nejsou s ní spojeny žádné další náklady.

SQL server
Je vhodný pro uživatele zpracovávajícího stovky tisíc dokladů ročně nebo vyžadujícího vyšší bezpečnost uložení dat. SQL server je vhodný rovněž při publikování výstupů z Info Office na Internetu nebo dalších specifických požadavcích uživatele. Nevýhodou je o něco složitější administrace databáze a vyšší pořizovací náklady na SQL server. Ty jsou vyváženy vyšší bezpečností a rychlostí při dotazech do rozsáhlých databází.
V současné době je k dispozici i verze pro klient/server, která je funkční s MS SQL serverem verze 7.

Cena verze pro klient/server je oproti základní verzi zvýšena o 25 000 Kč bez ohledu na počet zakoupených licencí. Tato cena zahrnuje rovněž instalaci produktu u uživatele. Ceny jednotlivých licencí jsou stejné jako pro základní verzi.